کمیسیون بررسی موارد خاص، درخواست دانشجویانی را که جریان تحصیل آنان با مشکل مواجه گردیده و همچنین دانشجویان اخراجی و یا در حال اخراج و دانشجویانی که بنا به دلایلی غیبت موجه دارند و مشکل آنان با مقررات و آئین‌نامه‌های آموزشی و پژوهشی موجود قابل حل نمی‌باشد، مورد بررسی قرار داده و اقدام به صدور رای می‌نماید. این کمیسیون در ماه دو بار تشکیل جلسه می‌دهد. رییس دانشگاه، معاون دانشجویی، معاون آموزشی و چهار عضو دیگر که از طرف رییس دانشگاه معرفی می‌شوند از جمله اعضای این کمیسیون می‌باشند.
انواع درخواست‌های قابل طرح در کمیسیون موارد خاص درخواست تمدید سنوات کمیسیونی، درخواست بخشش جرایم آموزشی، درخواست مجوز مشروط برای دفاع، درخواست لغو اخراج و درخواست انتقال می‌باشد.